青海卫生职业技术学院是全省唯一一所卫生类高职院校，其前身是1935年3月青海省卫生实验处举办的第一期种痘人员讲习班。1939年省政府开办医务佐理人员训练所，设医佐班和护士班。1943年，医务佐理人员训练所改名为卫生人员训练所。1948年10月，卫生人员训练所改名为省立高级护士职业学校，1948年春正式开学，马步芳兼任校长，学制三年，聘请专业人员任教。1949年9月学校由中国人民解放军第一军司令部卫生处接管。1950年学校与青海军区卫生学校合并为中国人民解放军第一军卫校，1951年7月中国人民解放军第一军奉命赴朝鲜参加抗美援朝战争，遂将该校移交给地方政府，正式建校为青海省中级卫生技术学校。
五十年代学校曾数次更改校名，1951年为青海省中级卫生技术学校，1954年为青海省卫生学校，1955年为青海省西宁卫生学校，1958年为青海省第一卫生学校，1960年第一卫校与第二卫校合并，改名为“青海省卫生学校”，此名沿用至2003年学校升格为青海卫生职业技术学院。1984年，经省政府批准，国家教委备案，在青海省卫生学校的基础上成立了“青海省卫生干部专科学校”并挂牌招生，承担省内成人医学专科教育任务。1990年省内5所职工专科学校合并成立了“青海省联合职工大学”，学校成为联合大学的卫生分校，当时三块牌子，一套领导班子。1993年经省教委评估，被省政府确定为“省部级重点中专学校”。
2001年3月被国家教育部确定为“国家级重点中等职业学校”，2003年正式升格为青海卫生职业技术学院。